იმის გამო, რომ DdNTP-ებს აქვთ წყალბადის მოლეკულა (-H) ჰიდროქსილის ჯგუფის (-OH) ნაცვლად, რომელიც მიმაგრებულია მისი დეზოქსირიბოზის 3'-C-ზე, ის ვერ აკავშირებს არცერთ შემოსულ ნუკლეოტიდს. ამიტომ, DdNTP-ების დამატება დნმ-ის რეპლიკაციის დროს შეიძლება გამოყენებულ იქნას სინთეზის რეაქციის შესაწყვეტად.
რატომ ჩერდება დნმ-ის სინთეზი, როდესაც ddNTP შედის დნმ-ის მზარდ ჯაჭვში?
თუ დამატებული ნუკლეოტიდი არის "დიდეოქსინუკლეოტიდი" (სურათი 6.29), მზარდი ჯაჭვის 3' ბოლოს ექნება H და არა OH. ეს ხელს შეუშლის დამატებითი ნუკლეოტიდების დამატებას; ანუ, ინ ვიტრო დნმ-ის სინთეზი ამ ეტაპზე შეჩერდება.
როგორ წყვეტს ddNTP დნმ-ის სინთეზს?
როდესაც ddNTP შედის ნუკლეოტიდების ჯაჭვში, სინთეზი მთავრდება. ეს იმიტომ ხდება, რომ ddNTP მოლეკულას აკლია 3' ჰიდროქსილის ჯგუფი, რომელიც საჭიროა ჯაჭვის შემდეგ ნუკლეოტიდთან კავშირის შესაქმნელად.
რატომ წყვეტს DdNTP-ები რეპლიკაციის პროცესს?
ლაბორატორიული მეთოდები ენზიმოლოგიაში: დნმ
დიდეოქსინუკლეოტიდი ტრიფოსფატები ადვილად შედის დნმ-ის მზარდ ჯაჭვში, მაგრამ არ გააჩნიათ 3' ჰიდროქსილის ჯგუფი, რომელიც აუცილებელია ჯაჭვის გასაგრძელებლადდა ეფექტურად შეწყვიტოს პოლიმერიზაცია.
რატომ იწვევს დიდოქსინუკლეოტიდები დნმ-ის რეპლიკაციის შეჩერებას?
ამ ddNTPs არ გააჩნია 3'-OH ჯგუფი, რომელიც საჭიროა ორს შორის ფოსფოდიესტერული ბმის ფორმირებისთვისნუკლეოტიდები, რაც იწვევს დნმ-ის ჯაჭვის გაფართოების შეჩერებას ddNTP-ის დამატებისას.
