არაბინოზა არის ხუთნახშირბადიანი შაქარი, რომელიც ფართოდ გვხვდება ბუნებაში და შეიძლება იყოს ნახშირბადის ერთადერთი წყარო მრავალ ბაქტერიაში. სამი გენის ცილოვანი პროდუქტები (araB, araA და araD) საჭიროა არაბინოზის დეგრადაციისთვის Enterobacteriaceae ოჯახის წევრებში, როგორიცაა E. coli და S..
რას უყენებს არაბინოზა ბაქტერიებს?
ამგვარად, როდესაც არაბინოზა არის არაბინოზას ოპერონის ჩართვისთვის, GFP წარმოიქმნება და ბაქტერიებს შეუძლიათ ფლუორესციონირება. არაბინოზის გარეშე, GFP გენი არ არის გამოხატული და არ არის ფლუორესცენცია. ამრიგად, მკვებავი შემადგენლობის ცვლილებით, მკვლევარს შეუძლია გააკონტროლოს, როდის (და თუ) ყვავილობა ხდება ტრანსფორმირებულ ბაქტერიებში.
რა როლი აქვს არაბინოზას ბაქტერიების ტრანსფორმაციაში?
არაბინოზა მოქმედებს როგორც AraC-ის ალოსტერული რეგულატორი, ცვლის დნმ-ის რომელ უბნებს უკავშირდება და როგორ აყალიბებს დიმერს. გახსოვდეთ, რომ არაბინოზა არის შაქარი, რომელიც კატაბოლიზდება AraBAD ოპერონის ცილებით. როდესაც არაბინოზა ემატება გარემოს, რომელშიც ცხოვრობს E. coli, ის მჭიდროდ უკავშირდება AraC-ს.
რატომ გამოიყენება არაბინოზა?
გამოყენება ბიოლოგიაში
სინთეზურ ბიოლოგიაში არაბინოზა ხშირად გამოიყენება როგორც ცალმხრივი ან შექცევადი გადამრთველი ცილის გამოხატვისთვის Pცუდიპრომოტორი E. coli-ში. ეს ჩამრთველი შეიძლება აღმოიფხვრას გლუკოზის არსებობით ან შეცვალოს გლუკოზის დამატებით კულტურის გარემოში, რაც კატაბოლიტის რეპრესიის ფორმაა.
როგორმოქმედებს არაბინოზა ბაქტერიებში გენის რეგულაციასა და ექსპრესიაზე?
როცა არაბინოზა არის, araC ამშვიდებს დნმ-ის კონფიგურაციას ისე, რომ ტრანსკრიფცია შეიძლება მოხდეს, მაგრამ როდესაც ეს ნახშირწყალი არ არის, იგივე ცილა ზღუდავს დნმ-ს, რათა შეამციროს მისი შეკავშირების უნარი. რნმ პოლიმერაზასთან ერთად.
