პრაიმერის დიმერის არტეფაქტები ჩვეულებრივ გვხვდება დიდი ზღვრული ციკლის რიცხვზე (ჩვეულებრივ > 35 ციკლი), რაც უფრო მაღალია, ვიდრე ზღვრული ციკლის ნომერი სასურველი ამპლიკონისთვის. პრაიმერის დიმერები საგრძნობლად იზრდება ჰეტეროლოგიური გენომიური დნმ-ის დამატებისას.
სად ნახავთ პრაიმერის დიმერებს დნმ-ის გელზე?
არარაოდენობრივი საბოლოო წერტილის PCR-ში, პრაიმერის დიმერი გამოჩნდება მეტ-ნაკლებად მკრთალი ნაცხის სახით აგაროზის გელზე, პროდუქტის ინტერესის დიაპაზონის ქვემოთ.
როგორ წარმოიქმნება პრაიმერის დიმერები?
პრაიმერის დიმერები წარმოიქმნება როდესაც ორი პრაიმერი ერთმანეთს უერთდება, შაბლონის დნმ-ის ნაცვლად, პრაიმერის კომპლემენტარობის რეგიონების გამო.
როგორ ამოიცნობთ პრაიმერის დიმერებს?
პრაიმერი-დიმერების შესამოწმებლად ყველაზე მარტივი გზაა თქვენი რეაქციების შედარება თქვენს უარყოფით კონტროლთან (წყალი დნმ-ის ან რნმ-ის ნაცვლად). პრაიმერის დიმერები კვლავ წარმოიქმნება უარყოფით კონტროლში. ზოგიერთი პრაიმერის ნაკრები უფრო მეტად აყალიბებს დიმერებს, ვიდრე სხვები.
რატომ ჩნდება პრაიმერის დიმერები?
ძირითადად პრაიმერის დიმერები გვხვდება პრაიმერის მაღალი კონცენტრაციის გამო PCR რეაქციის ნარევში. ან თუ არ არის PCR გაძლიერება და შეგიძლიათ ნახოთ პრაიმერის დიმერზე აგაროზის გელში. თუ თქვენ შეგიძლიათ ნახოთ PCR პროდუქტი, მაშინ შეგიძლიათ შეამციროთ პრაიმერის კონცენტრაცია და შეინარჩუნოთ სხვა პირობები იგივე.
