მოლეკულურ ბიოლოგიაში STRING (საძიებო ინსტრუმენტი ურთიერთდაკავშირებული გენების/პროტეინების მოსაძიებლად) არის ბიოლოგიური მონაცემთა ბაზა და ვებ რესურსი ცილა-ცილის ცნობილი და პროგნოზირებული ურთიერთქმედების შესახებ. … უახლესი ვერსია 11b შეიცავს ინფორმაციას 5000-ზე მეტი ორგანიზმის 24,5 მილიონ ცილაზე.
რა არის STRING მონაცემთა ბაზის მიზანი?
STRING მონაცემთა ბაზა მიზნად ისახავს შეაგროვოს და გააერთიანოს ეს ინფორმაცია ცნობილი და პროგნოზირებული პროტეინის–პროტეინის ასოციაციის მონაცემების კონსოლიდაციით დიდი რაოდენობით ორგანიზმებისთვის.
რა არის STRING ქულა?
STRING-ში ცილა-ცილის თითოეული ურთიერთქმედება ანოტირებულია ერთი ან მეტი „ქულით“. მნიშვნელოვანია, რომ ეს ქულები არ მიუთითებს ურთიერთქმედების სიძლიერესა და სპეციფიკაზე. ამის ნაცვლად, ისინი წარმოადგენენ ნდობის ინდიკატორებს, ანუ რამდენად სავარაუდოა, რომ STRING თვლის ურთიერთქმედებას ჭეშმარიტად, არსებული მტკიცებულებების გათვალისწინებით.
რატომ ურთიერთქმედებენ ცილები?
ცილა-პროტეინის ურთიერთქმედება (PPIs) არის მაღალი სპეციფიკის ფიზიკური კონტაქტები, დამყარებული ორ ან მეტ ცილის მოლეკულას შორის ბიოქიმიური მოვლენების შედეგად გამოწვეული ურთიერთქმედებებით, რომლებიც მოიცავს ელექტროსტატიკურ ძალებს, წყალბადს. შემაკავშირებელი და ჰიდროფობიური ეფექტი.
რა არის ფუნქციონალური ასოციაცია?
განმარტება. ორობითი ურთიერთობა ბიოლოგიურ ერთეულებს შორის როდესაც ერთ-ერთი მათგანი მოდულირებს მეორეს მეორის ფუნქციის, გამოხატვის, დეგრადაციის ან სტაბილურობის და ურთიერთობის თვალსაზრისით.პარტნიორებს შორის არ შეიძლება დადგინდეს, როგორც პირდაპირი, ამიტომ შუალედური საფეხურები აშკარად არის წარმოდგენილი.
