სად არის ნაპოვნი DNase I ჰიპერმგრძნობელობის ადგილები და რას მიუთითებენ ისინი ქრომატინის ბუნებაზე? ეს ადგილები გვხვდება ეგზონ-ინტრონის შეერთებაზე და მიუთითებს mRNA დაშლის ადგილს შერწყმის დროს. ეს ადგილები შემთხვევით გვხვდება მთელ გენომში და ეს ხდის დნმ-ს დაუცველს დეგრადაციისთვის.
რა არის DNase I ჰიპერმგრძნობიარე საიტი და როგორ მოქმედებს ის ქრომატინზე?
გენეტიკაში, DNase I ჰიპერმგრძნობიარე ადგილები (DHS) არის ქრომატინის რეგიონები, რომლებიც მგრძნობიარეა DNase I ფერმენტის გაყოფის მიმართ. გენომის ამ კონკრეტულ რეგიონებში ქრომატინმა დაკარგა კონდენსირებული სტრუქტურა, ავლენს დნმ-ს და ხდის მას ხელმისაწვდომს.
რას გვთავაზობს DNase ჰიპერმგრძნობიარე საიტი?
აქტიური cis-მარეგულირებელი ელემენტები ჰიპერმგრძნობიარეა ენდონუკლეაზა DNase I-ის მიერ დაშლის მიმართ. მოტივები DNase I ჰიპერმგრძნობიარე უბნებში მიუთითებს პოტენციურ ტრანს-მოქმედი ფაქტორის დაკავებაზე და DNase I-თან შერწყმისას. დაშლის მონაცემები, შეიძლება გამოყენებულ იქნას დროებითი მარეგულირებელი ქსელების ასაგებად.
რა არის DNase ჰიპერმგრძნობელობის ანალიზი?
ორ ათწლეულზე მეტი ხნის განმავლობაში, DNase I ჰიპერმგრძნობელობის ანალიზი (DHA) იყო ინსტრუმენტული მარეგულირებელი დომენების აღმოჩენისთვის (11). ეს მეთოდი ასახავს გენომში არსებულ დისკრეტულ ადგილებს, სადაც ქრომატინის კონფორმაცია ხდის მის დნმ-ს ჰიპერმგრძნობელობას ენდონუკლეაზა DNase I (12) მიერ დაშლის მიმართ.
რა არის ნუკლეაზას ჰიპერმგრძნობიარე ადგილი ქრომატინში?
შიქრომატინის, ნუკლეოსომისგან თავისუფალი რეგიონები, რომლებიც ცნობილია როგორც ნუკლეაზას ჰიპერმგრძნობიარე ადგილები, ითვლება, რომ ასახავს "ღია ფანჯრებს", რომლებიც საშუალებას აძლევს გადამწყვეტი რეზიდენტი ცის-მოქმედი დნმ-ის მიმდევრების გაძლიერებულ წვდომას ტრანს-მოქმედ ფაქტორებზე (იხ..
